É exactamente como o amigo abelha disse.
O track nada mais é que um conjunto de pontos que são posteriormente unidos um a um.
Isso é normal acontecer, e não é possível teres a track 100% igual ao que fizeste.
A única coisa que podes fazer é, nas definições, alterar a frequência com que a unidade grava o ponto. Poderás ter isso definido para fazer em intervalos muito espaçados, ampliando esse problema.
Também acontece devido a sinais fracos de GPS, em que a tua posição não corresponde exactamente à que o GPS está a ler, mas isso origina é aqueles bicos que por vezes nos aparecem nos tracks.
Mas entre as couves é normal isso acontecer... Não há milagres...